Ik vond een oplossing hoe de voettekst van de vervolgsecties kon worden vervangen:
MainDocumentPart myPart = document.MainDocumentPart;
FooterPart newFtPart = myPart.AddNewPart();
string ft_ID = myPart.GetIdOfPart(newFtPart);
new DocumentFormat.OpenXml.Wordprocessing.Footer().Save(newFtPart);
foreach (SectionProperties sectProperties in myPart.Document.Descendants().Skip(1))
{
FooterReference newFtReference =
new FooterReference() { Id = ft_ID, Type = HeaderFooterValues.Default };
sectProperties.Append(newFtReference);
}